Значение морских лилий в геологических отложениях заключается в том, что их окаменелые остатки относятся к одним из наиболее распространённых ископаемых. 3

В отложениях палеозоя и мезозоя находят скопления и целые пласты значительной мощности, образованные остатками стеблей морских лилий. 2 Такие известковые породы носят название криноидных или энкринитовых. 2

Кроме того, остатки морских лилий могут быть использованы для стратиграфического анализа геологических разрезов, например, при расчленении и сопоставлении разрезов нижнего мела Крыма. 1

Также стебли морских лилий могут служить индикаторами геологического времени, так как их используют как индикаторы геологического времени наравне с другими древними организмами. 5