В сельском хозяйстве комнатные мухи могут иметь следующее значение:

• Переработка отходов. 12 Личинки мух способны перерабатывать в зоогумус две тонны навоза или птичьего помёта в сутки. 2
• Производство удобрений. 5 С помощью личинок комнатной мухи можно сократить сроки изготовления экологически чистых удобрений. 5
• Получение белкового корма. 1 Личинки мух могут служить кормом для коров, свиней, кур. 1

В биотехнологиях комнатные мухи могут использоваться, например, для производства:

• Косметических средств и лекарств. 4 В Китае построена фабрика, где из личинок комнатной мухи производят косметические средства и лекарства. 4
• Антибиотиков. 4 Согласно исследованиям зарубежных учёных, антибиотики XXI века планируют производить из личинок комнатной мухи. 4

Однако у комнатных мух есть и отрицательное значение: они могут служить переносчиками патогенных организмов, возбудителей болезней домашней птицы и крупного рогатого скота. 3