Хромосомные инверсии имеют важное значение для видообразования, в частности, способствуют симпатрическому видообразованию (зарождению двух или нескольких видов на одной территории). 2

Несколько причин, как инверсии влияют на этот процесс:

• Подавление рекомбинации. 24 Если инверсия включает набор генов, которые полезны для выживания в конкретных условиях, то этот набор будет оставаться целостным. 2 Он не будет рассеиваться по геному, смешиваясь с другими вредными или бесполезными аллелями. 2
• Защита от вредных последствий гибридизации. 4 Благодаря инверсиям гибридное потомство реже получает конфликтующие комбинации генов. 4
• Препятствие обратному слиянию недавно разделившихся видов. 4 Инверсии помогают видам сохранять свою идентичность даже в условиях частой гибридизации. 4

Например, популяции губастика крапчатого, получив инверсию, захватившую гены сроков цветения, разделились сообразно местным климатическим условиям. 2