Работа Карла Везе имела важное значение для современной биологии, в частности:

• Создание трёхдоменной системы классификации. 1 Везе разделил жизнь на три домена: бактерии, археи и эукарии, основываясь на филогенетических связях, а не на очевидном морфологическом сходстве. 1 Это внесло логику в учение о систематике прокариот и дало новое понимание путей эволюционного развития. 3
• Изучение эволюции безъядерных организмов. 2 Везе дополнил знания о том, как работает «эволюционный хронометр» на основе рибосомной РНК. 2 Он обнаружил фрагменты рибосомы, которые почти не изменяются у всех организмов. 2
• Новый подход к изучению микроорганизмов. 2 Везе предложил секвенировать все, что содержится в образце, а потом уже собирать прочитанные геномы. 2 Это продвинуло геномику микроорганизмов, ведь лишь малая их часть может расти в лабораторных условиях. 2
• Изучение природных микробных популяций. 3 Работы Везе породили новое направление — использование секвенирования для изучения природных микробных популяций (сейчас это называют метагеномикой). 3 С помощью этого метода были определены тысячи новых организмов в океанской воде и теле человека. 3