Теория симбиогенеза имеет важное значение для современной науки, в частности:

• Помогает понять эволюцию. 1 Теория подчёркивает роль кооперации и симбиоза как движущих сил эволюции наряду с конкуренцией и естественным отбором. 1 Это позволяет раскрыть сложные взаимодействия между организмами и объяснить возникновение новых видов и биологических функций через интеграцию и взаимосвязь, а не только через постепенные мутации и отбор. 1
• Даёт возможность решить ряд общебиологических проблем. 2 Например, объяснить возникновение клетки и её генома. 2
• Открывает перспективы для искусственного воспроизведения симбиогенеза. 3 Это может быть направлено на синтез новых организмов и биосистем, обладающих заданным комплексом практически значимых признаков. 3
• Подтверждается современными генетическими и молекулярными исследованиями. 1 Анализ геномов митохондрий и хлоропластов показывает их близкое родство с определёнными группами прокариотических организмов, что ещё раз подчёркивает важность симбиоза в эволюции жизни на Земле. 1