Присутствие пептидогликана в клетках прокариот имеет следующее значение:

• Защита от внешних воздействий (механических, химических и других). 2 Пептидогликан образует жёсткую защитную оболочку. 14
• Обеспечение выживаемости бактерий. 4 Пептидогликан сопротивляется силе, возникающей за счёт внутренней осмолярности клетки, и препятствует разрыванию клетки изнутри. 14
• Поддержание формы бактериальной клетки. 14 Это положительно сказывается на стабильности существования прокариот. 1
• Транспорт веществ в бактериальную клетку и за её пределы. 1 Пептидогликан участвует в фото- и хемосинтезе, фиксации азота и других важных процессах клеточной жизнедеятельности. 1
• Участие в движении клетки. 1 Это осуществляется за счёт наличия у него ворсинок и жгутиков, имеющих мембранную структуру и плотно связанных с пептидогликаном. 1