Перекрёстное оплодотворение имеет следующее значение для эволюции и адаптации организмов:

• Появление генетического разнообразия внутри вида. 1 Признаки родительских организмов комбинируются, возникает множество новых вариантов, что приводит к появлению новых комбинаций признаков. 1
• Повышение способности вида адаптироваться к изменениям окружающей среды. 4 Это происходит благодаря тому, что перекрёстное оплодотворение помогает поддерживать больший диапазон изменчивости, на который может воздействовать естественный отбор. 4
• Помощь в накоплении полезных мутаций. 2 Перекрёстное оплодотворение даёт немедленное адаптивное преимущество по сравнению с самооплодотворением, так как позволяет объединять полезные мутации в одном геноме. 2