Значение гидробиологии для изучения водных экосистем заключается в следующем:

• Понимание экологических процессов в водной среде. 13 Гидробиология изучает взаимодействие гидробионтов, их популяций и сообществ между собой и с абиотическими компонентами водных экосистем. 12
• Изучение общих внутренних закономерностей структурно-функциональной организации водных экосистем. 13 Они определяют круговорот вещества и поток энергии в них. 3
• Решение практических задач: 13
• повышение биологической продуктивности водоёмов для получения из них наибольшего количества биологического сырья; 13
• разработка биологических основ обеспечения людей чистой водой, в том числе оптимизация функционирования экосистем, создаваемых для промышленной очистки питьевых и сточных вод; 13
• экспертная оценка экологических последствий зарегулирования, перераспределения и переброски стока рек, антропогенного изменения гидрологического режима озёр и морей; 13
• оценка влияния вновь создаваемых промышленных, сельскохозяйственных и других предприятий на водные экосистемы с целью охраны последних от недопустимых повреждений; 13
• мониторинг состояния водных экосистем. 13