Эффект основателя имеет важное значение для эволюционной биологии и генетики, так как он влияет на формирование популяций и видообразование. 13

В эволюционной биологии эффект основателя может способствовать образованию новых видов, поскольку в крайних случаях приводит к видообразованию и последующей эволюции. 3 Учёные полагают, что многообразие видов на Земле, в частности в морях и океанах, в какой-то мере обусловлено именно эффектом основателя. 1

В генетике эффект основателя связан с снижением и смещением генетического разнообразия, когда небольшое количество представителей вида заселяет новую географическую территорию. 4 В результате новая популяция может отчётливо отличаться от родительской, из которой она произошла. 3

Некоторые области применения эффекта основателя в генетике и эволюционной биологии:

• Изучение степени родства между популяциями и путей расселения видов. 4
• Оценка путей расселения древних людей, а также степени родства между современными популяциями или народами. 4
• Изучение процессов естественного отбора, в частности на примере островных популяций животных и растений. 5 Учёные выяснили, что генетическое наследие основателей сохраняет важную роль в разнообразии популяций в изолированных местообитаниях, даже на фоне их быстрой эволюции под действием естественного отбора. 5