Архипелаг Кергелен имеет большое значение для научных исследований. 14 Благодаря своему географическому положению он удобен для метеорологических и геофизических наблюдений. 14

Своеобразное геомагнитное положение Кергелена позволяет проводить исследования в области ионосферы, космического излучения, земного магнетизма, атмосферной радиоактивности. 4 Также на архипелаге учёные занимаются палеонтологией. 4

Кроме того, в 2020 году на островах Кергелена французские и австралийские геологи обнаружили в южной части Индийского океана зарождающийся континент. 2 По их мнению, гранитная магма и континентальная кора могут образовываться в центре океанов, и таким образом зарождаются новые континенты. 2