Значение автотрофных организмов для экосистем и биогеохимических циклов заключается в следующем:

• Они являются первичными продуцентами органического вещества в биосфере, образуя первый трофический уровень наземных экосистем. 1
• Создаваемые автотрофными организмами вещества необходимы в качестве источника энергии для гетеротрофных организмов (животные, паразитические растения, грибы, актиномицеты). 1
• Благодаря появлению автотрофных организмов на Земле около 2 млрд лет назад началось накопление в атмосфере свободного кислорода, что явилось важнейшим этапом в развитии биосферы. 1
• Автотрофные организмы участвуют в почвообразовательном процессе, формировании экоклимата, биологическом и геологическом круговороте веществ, регулировании гидрорежима поверхностных и грунтовых вод, противоэрозионном процессе. 2