Структура воды оказывает следующее влияние на её физические свойства:

• Упорядоченность структуры в твёрдом состоянии объясняет меньшую плотность льда по сравнению с жидкой водой. 3 В результате водоёмы практически никогда не промерзают до дна, и обитающие в них живые организмы не гибнут. 1
• Высокая прочность водородных связей объясняет высокие значения температур кипения и плавления: для разрыва водородных связей между молекулами воды требуется больше энергии. 24
• Дополнительные связи между молекулами воды придают жидкой воде большую удельную теплоёмкость. 2 Такая высокая теплоёмкость делает воду хорошим накопителем тепла (хладагентом) и теплозащитным экраном. 2
• Способность жидкой воды сохранять структуру объясняет и свойства «памяти» воды: изменение положения одного структурного элемента в кластере воды под действием внешнего фактора обеспечивает чувствительность информационной системы воды. 3