Правило Чаргаффа оказывает следующее влияние на синтез белка: обеспечивает точное соответствие аминокислот в процессе трансляции. 2

Согласно этому правилу, количество аденина равно количеству тимина, а гуанина — цитозину. 14 Это позволяет молекулам тРНК приносить новые аминокислоты, соответствующие кодонам иРНК, и соединять их друг с другом, образуя пептидные связи и наращивая молекулу белка. 2

Кроме того, правило Чаргаффа влияет на использование кодонов в бактериальных геномах, где кодирующие последовательности распределены неравномерно. 4 Из-за асимметрии в использовании пиримидина и пурина в кодирующих последовательностях цепь с большим содержанием кодирующих оснований, как правило, будет иметь большее количество пуриновых оснований. 4