Гидрофобный эффект оказывает следующее влияние на формирование клеточных мембран:

• Предотвращает смешивание внутренней водной среды клетки с внешней водой. 1 Клеточные мембраны состоят из амфифильных фосфолипидов, и гидрофобный эффект объединяет молекулярные компоненты в биомембране, препятствуя их выходу в водную фазу за её пределы. 4
• Упорядочивает молекулы фосфолипидов. 25 При образовании мембран гидрофобные участки молекул оказываются обращены внутрь мембраны, а гидрофильные — наружу, с обеих внешних сторон мембраны. 3
• Определяет стабильность биомембран в воде. 4 Амфифильность мембранных липидов, к которым относится и холестерин, регулирует жидкое состояние мембраны, определяет её упругость и эластичность. 25