Фенотип оказывает следующее влияние на индивидуальное развитие организма:

• Определяет норму реакции. 3 Генотип определяет не фенотип как таковой, а определённый спектр возможностей развития. 3 Какая из этих возможностей будет реализована, зависит уже не от генов, а от условий, в которых будет происходить развитие организма. 3
• Формирует адаптацию. 1 Приспособляемость организмов ко многим изменениям внешних условий может быть достигнута путём фенотипических модификаций (включая изменения поведения) в пределах существующей нормы реакции генотипа без его преобразований. 1
• Участвует в компенсаторных изменениях. 3 Живые организмы способны к «компенсаторным фенотипическим модификациям», то есть таким прижизненным изменениям, которые компенсируют эффекты различных травм (пример — регенерация). 3
• Имеет эволюционное значение. 1 Вызванные внешними воздействиями изменения фенотипа (модификации) имеют не только адаптивное, но и важное эволюционное значение благодаря возможности наследственного закрепления фенотипических признаков под воздействием стабилизирующего отбора. 1