При близкородственном скрещивании повышается уровень гомозиготности организмов. 2 Другими словами, увеличивается вероятность того, что потомство получит идентичные аллели от матери и отца. 2

Гомозиготность увеличивается с последующими поколениями, поэтому рецессивные признаки, которые в противном случае могли бы быть замаскированы, могут начать проявляться в результате повторного инбридинга. 2

В гомозиготное состояние могут перейти и вредные рецессивные гены, что приводит к снижению жизнеспособности потомства или к гибели. 1

Также при близкородственном скрещивании сокращается генетическое разнообразие, что может снижать биологическую приспособленность организмов. 2

С другой стороны, повышение гомозиготности может способствовать закреплению выдающихся качеств отдельных особей, что используется в селекции. 4