Массовые вымирания оказали следующее влияние на развитие фауны кайнозойской эры:

• Обновляли биоту и меняли генеральные пути развития организмов. 2 Как правило, при крупных вымираниях в первую очередь выбивались продуценты, и животным становилось нечего есть. 2 Также часто менялся химический состав океана, что делало его неблагоприятным для строительства раковин и других скелетов. 2
• Обусловили ароморфоз одних видов и вымирание других. 1 Например, хорошо чувствовавшие себя в холодный период мамонты не смогли приспособиться к потеплению и не дожили до наших дней. 1
• Способствовали выживанию некоторых видов. 3 Шансы на выживание повышались у животных с высокой численностью, широкими ареалами, способностью адаптироваться к разным местообитаниям и есть разную пищу. 3

Кроме того, массовые вымирания привели к тому, что в начале кайнозойской эры значительно возросло количество видов покрытосеменных растений. 15 Именно их плоды служили основным источником пищи для многих млекопитающих. 1