Эволюционное значение стадии гаструлы у многоклеточных животных заключается в том, что её наличие служит одним из доказательств единства происхождения животных. 35
Согласно биогенетическому закону Геккеля—Мюллера, это обстоятельство указывает на существовавшего у всех многоклеточных животных общего предка, по строению напоминавшего гаструлу современных животных. 3
Также на стадии гаструлы начинает формироваться будущая пищеварительная система: образуется гастральная полость, сообщающуюся с окружающим пространством через отверстие, называемое первичным ртом. 2
Кроме того, дальнейшая специализация клеток зародышевых листков на стадии гаструлы обеспечивает формирование тканей и органов, то есть гисто- и органогенез. 1