Цитохром перемещает катионы водорода через мембрану тилакоида в процессе фотосинтеза. 13

Протоны водорода появляются не только при фотолизе воды, но и закачиваются в люмен тилакоида из стромы одним из переносчиков, например пластохиноном. 3 Это происходит для того, чтобы с одной стороны мембраны накопилось достаточно много протонов водорода. 3

Их накапливается настолько много, что внутри тилакоида рН может достигать 4 (кислая среда), тогда как в строме рН имеет значение около 8 (слабощелочная среда), что создаёт градиент концентрации. 3

При прохождении протонов водорода через АТФазу некоторые её компоненты меняют свою конформацию, при этом выделяется энергия, которая сразу же расходуется на присоединение фосфата к АДФ и формирование макроэргической связи, другими словами, на образование АТФ из АДФ. 3