Какие возможности предоставляет PyMOL для визуализации и анализа биологических данных?

PyMOL — система молекулярной визуализации, которая позволяет создавать трёхмерные изображения мелких молекул, биологических молекул, молекулярных поверхностей, траекторий и прочего. zenway.ru

Некоторые возможности PyMOL для визуализации и анализа биологических данных:

• Представление данных. www.diagnosticsworldnews.com pymol.org Программа позволяет представлять информацию почти в 20 различных форматах. www.diagnosticsworldnews.com pymol.org Например, с помощью сфер можно получить вид, похожий на CPK, поверхности и сетки — более объёмный вид, линии и палочки — акцент на связях, а лента и мультфильм — популярное представление для идентификации вторичной структуры и топологии. pymol.org
• Измерение расстояний, углов и других параметров. www.diagnosticsworldnews.com www.fitzkee.chemistry.msstate.edu Система может рассчитать, есть ли потенциальное взаимодействие между молекулами, измеряя расстояние между ними. www.diagnosticsworldnews.com По углам связей можно определить рациональность молекулярной структуры. www.diagnosticsworldnews.com
• Редактирование молекулярных объектов. www.diagnosticsworldnews.com Можно выполнять модификации молекул, например, создавать и заменять связи, атомы, остатки и общие химические группы. www.diagnosticsworldnews.com
• Экспорт данных. zenway.ru PyMOL позволяет экспортировать просматриваемые и редактированные трёхмерные структуры в файлы форматов VRMI 2 WRL, COLLADA и ROV. zenway.ru Также можно экспортировать презентацию в видеоролик (MPEG) и изображение формата PNG. zenway.ru
• Расширение функциональности. zenway.ru PyMOL легко расширяется с помощью плагинов и пользовательских скриптов. zenway.ru