Существует несколько видов тРНК, например:

• Цитоплазматические тРНК, которые кодируются ядерной ДНК. 1
• Особые виды тРНК, которые кодируются автономными геномами митохондрий и хлоропластов. 1
• Митохондриальные тРНК растений, которые укладываются в обычный клеверный лист. 1
• Митохондриальные тРНК животных, у которых в большей или меньшей степени укорочены T- и D-петли. 1
• Митохондриальные тРНК паразитических червей нематод, которые значительно короче классических тРНК, их длина составляет от 54 до 65 нуклеотидов. 1

Различия между тРНК могут быть связаны с их функциями и антикодонами. 15

Несколько различных тРНК могут соединяться с одной и той же аминокислотой, такие тРНК называются изоакцепторными. 1 Разные изоакцепторные тРНК могут узнавать разные кодоны для данной аминокислоты. 1

Последовательность оснований в антикодоне напрямую зависит от вида аминокислоты, прикреплённой к 3'-концу. 2 Так, например, тРНК, антикодон которой имеет последовательность 5'-ЦЦА-3', может нести только аминокислоту триптофан. 2

Каждой из 20 аминокислот соответствует своя тРНК, а для некоторых аминокислот существует несколько тРНК. 3