Для совместного выращивания в аквапонике подходят разные виды рыб и растений, но при выборе культур нужно учитывать требования организмов к освещению, температуре и составу воды. 5

Некоторые виды рыб, которые хорошо себя показывают в условиях аквапоники: тилапия, окунь, сом. 35 Эти рыбы недорогие, легко адаптируются к окружающей среде, хорошо переносят перепады температуры, высокий уровень pH и аммиака. 5

Среди растений для аквапоники подходят культуры с неглубокой корневой системой: зелень (салат, шпинат, базилик, мята), овощи (огурцы, помидоры черри, перец), цветы (петунии, настурции). 4 Избегают растений, требующих кислой почвы (голубика, рододендроны), так как вода в аквапонике имеет нейтральный pH. 4

Некоторые виды растений, которые можно выращивать в аквапонике: листовой салат, репа, кудрявая капуста, свёкла, руккола, базилик, мята, жеруха обыкновенная, лук скорода, большинство домашних декоративных растений. 1

Для полноценной работы системы необходим баланс между количеством рыбы и растений. 3 Если рыбы будет больше допустимого для тех или иных растений количества, то бактерии не успеют переработать аммиак, который вырабатывает рыба, и рыбы отравятся. 3