Некоторые уникальные биохимические процессы, характерные для архебактерий:

• Метаногенез. 1 Форма анаэробного дыхания, при которой образуется метан. 1 Для метаногенеза необходимо множество различных коферментов, уникальных для архебактерий, таких как кофермент М и метанофуран. 2
• Фотофосфорилирование. 5 Единственный пример превращения энергии света в химическую энергию АТФ без участия электронтранспортной цепи. 5
• Использование разнообразных источников энергии. 2 Архебактерии могут получать энергию из органических соединений, аммиака, ионов металлов и даже водорода. 2
• Фиксация углерода. 2 Некоторые архебактерии используют атмосферный углекислый газ как источник углерода. 2 Этот процесс включает в себя либо сильно изменённый цикл Кальвина, либо метаболический путь, известный как 3-гидроксилпропионат/4-гидроксибутиратный цикл. 2
• Образование ацетата при деградации белков. 2 Архебактерии также имеют гены, необходимые для восстановления элементарной серы и тиосульфата, поэтому они участвуют в круговороте серы. 2