Некоторые типы центромер, которые существуют у разных организмов:

• Точечные центромеры. 2 В них волокна митотического веретена притягиваются к определённым последовательностям ДНК. 2
• Региональные центромеры. 12 Такие центромеры есть у людей и большинства эукариотических клеток. 2 Их местоположение определяется во время связывания митотического веретена комбинацией характеристик, а не точной последовательностью ДНК. 2

Также существует классификация по положению центромеры на хромосоме: 2

• Метацентрическая. 1 Центромера расположена посередине между концами хромосом, в результате чего плечи примерно равны по длине. 1
• Субметацентрическая. 1 Центромера расположена ниже середины, при этом одно плечо хромосомы короче другого, что часто приводит к L-образной форме. 1
• Акроцентрическая. 1 Центромера расположена таким образом, что одно из плеч хромосомы намного короче другого. 1
• Телоцентрическая. 1 Центромера расположена на одном из терминальных концов. 2

Кроме того, у нематоды Caenorhabditis elegans и некоторых растений хромосомы голоцентрические, то есть образование кинетохора не локализовано определённым участком, а происходит диффузно по всей длине хромосомы. 3