Некоторые стандарты и правила для обозначения генов и белков в разных биологических базах данных:

• Наименования генов. 1 Гены позвоночных имеют имена, которые представляют собой короткие идентификаторы (обычно от 3 до 8 символов). 1 Например, ген белка 4, ассоциированного с цитотоксическими Т-лимфоцитами — CTLA4. 1 Символы обычно создаются путём сокращения или аббревиатуры названия. 1 Каждому гену присваивается уникальный символ, идентификатор HGNC (в формате HGNC:#) и описательное имя. 1 Символы должны содержать только латинские буквы и арабские цифры, не должны содержать знаков препинания или буквы «G» для гена. 1
• Идентификаторы белковых структур. 2 Например, в базе Protein Data Bank каждая запись обладает уникальным идентификатором, состоящим из четырёх символов, каждый из которых может быть цифрой или буквой английского алфавита. 2 Если файл базы содержит информацию о нескольких различных молекулах одного комплекса, то для обращения к конкретной цепи к идентификатору записи добавляется символ (буква или цифра), обозначающий последовательность. 2
• Унификация описаний. 2 Например, в базе GO (Gene Ontology consortium database) стремятся к единообразию в описаниях функций, биологических процессов и клеточных компонентов, относящихся к продуктам генов. 2 Унификация описаний в различных базах данных облегчает поиск в них нужного гена. 2