Несколько способов решения проблем с зависимостями в научных библиотеках Python:

• Использование виртуальных сред. 2 Они изолируют зависимости проекта от глобального пространства Python и помогают избежать конфликтов между библиотеками. 2
• Регулярное обновление зависимостей. 2 Для этого можно использовать инструменты, например pip-review или pyup. 2 При обновлении стоит внимательно изучать изменения в changelog каждой библиотеки, чтобы понимать, какие изменения вносятся и как они могут повлиять на проект. 2
• Использование инструментов для управления зависимостями. 2 Например, Poetry или Pipenv. 2 Они позволяют точно фиксировать версии библиотек и автоматически управлять виртуальными окружениями. 2
• Применение больших языковых моделей (LLM). 3 Например, техника PLLM создаёт среду тестирования, которая итеративно запрашивает у LLM комбинации модулей, тестирует предложенные изменения и предоставляет LLM обратную связь для уточнения исправления. 3
• Визуализация графа зависимостей. 5 Для этого можно использовать библиотеки, например Pydeps или snakefood. 5