Некоторые системы аппликатур для флейты:

• Французская система. 12 Распространена на поперечных флейтах. 2 На нотном стане показаны ноты всего диапазона флейты от первой до четвёртой октавы, а под ним расположены графические схемы с указанием открытых и закрытых клапанов. 2
• Немецкая система. 1

Также существуют альтернативные варианты аппликатуры, когда одну и ту же ноту можно извлечь разным набором открытых и закрытых клапанов флейты. 2 Например, синим цветом закрашены такие варианты, когда одну и ту же ноту можно извлечь при одном и том же положении пальцев на инструменте, а разная высота ноты достигается другими приёмами, например, изменением силы и направленности струи выдуваемого воздуха. 2