Некоторые синонимы к словосочетанию «иметь отличие»:

• дифференцироваться; 1
• выделяться; 1
• отличаться; 1
• разниться; 1
• быть не похожим; 1
• различаться; 1
• диссоциироваться; 1
• отступать; 1
• отклоняться; 1
• расходиться; 1
• дивергировать; 1
• несходиться. 1

Также на сайте «Учи.ру» в качестве синонима к словосочетанию «иметь отличие» предлагают использовать выражение «быть разными». 2

Ещё несколько синонимов к слову «отличие»: различие, разница, разность, несходство, несхожесть. 45