Некоторые проблемы, которые могут возникать при глубоком копировании рекурсивных объектов:

• Рекурсивный цикл. 5 Рекурсивные объекты могут привести к бесконечной рекурсии. 2 В Python для предотвращения переполнения стека есть ограничение на максимальную глубину рекурсии. 2
• Копирование слишком большого количества данных. 5 Поскольку глубокая копия копирует всё, она способна скопировать слишком много, например, административные структуры данных. 5
• Проблемы с клонированием некоторых объектов. 13 Например, для Error и узлов DOM невозможно применить структурное клонирование. 3
• Проблемы с прототипами. 13 Если использовать функцию для копирования с экземпляром класса, то в качестве возвращаемого объекта будет простой объект, так как структурное клонирование отбрасывает цепочку прототипов объекта. 1

Для работы со сложными структурами данных могут использоваться библиотеки, например Immutable.js, или собственные функции копирования, которые учитывают рекурсию и другие особенности данных. 4