Какие существуют поколения секвенсоров ДНК и в чем их особенности?

Выделяют несколько поколений секвенсоров ДНК: dzen.ru

1. Первое поколение основано на методе, который в 1977 году предложил Фредерик Сэнгер. dzen.ru Главным ограничением способа является то, что с его помощью дорого и сложно восстанавливать последовательности нуклеотидов или «букв» генетического кода длиннее 1000 пар оснований. dzen.ru На практике секвенаторы первого поколения используются для определения мутаций в определённых, заранее установленных местах генома, выявления относительно коротких геномов вирусов, и для судебно-медицинских экспертиз. dzen.ru

2. Второе поколение (next generation sequencing, NGS) опирается на фиксирование изменений, которые происходят, когда достраивается цепь ДНК. dzen.ru Секвенаторы второго поколения позволяют прочитывать до 300 пар оснований и работать с большим количеством образов за один раз, что снижает себестоимость исследований. dzen.ru

3. Третье поколение секвенаторов опирается на изменение силы электрического тока при прохождении ДНК-цепочки через нанопоры. dzen.ru Такой подход позволяет уменьшить габариты прибора до считанных сантиметров и проводить анализ образцов в полевых условиях или на выезде, что дополнительно снижает трудоёмкость и себестоимость процедуры. dzen.ru

4. Четвёртое поколение предполагает считывание состава нуклеиновых кислот непосредственно в фиксированных клетках и тканях. genomemedicine.biomedcentral.com Такой подход открывает перспективы для транскриптомного анализа, валидации биомаркеров, постановки диагноза и стратификации пациентов для лечения рака. genomemedicine.biomedcentral.com