Некоторые методы исследования транскриптов в геномике:

• Northern blot. 1 Классический метод для детекции специфических РНК, использует гелевый электрофорез и гибридизацию с мечеными зондами для количественного анализа экспрессии генов в клеточных популяциях. 1
• RT-PCR (обратная транскрипция ПЦР). 1 Позволяет количественно измерять уровни экспрессии отдельных генов с высокой чувствительностью, используя комплементарную ДНК (кДНК) в качестве матрицы. 1
• Микрочипы для анализа экспрессии генов. 1 Высокопроизводительный метод для параллельного анализа экспрессии тысяч генов с использованием гибридизации к ДНК-зондам на чипе, позволяет проводить анализ дифференциальной экспрессии между различными типами клеток или условиями. 1
• RNA-seq (секвенирование РНК). 1 Современный и наиболее мощный метод, позволяющий получать данные обо всей транскриптомной активности клеток с высоким разрешением и точностью, включая определение последовательности транскриптов и их количественный анализ в различных клеточных типах и состояниях. 1
• «Анализ с помощью защиты от рибонуклеазы» (Ribonuclease protection assay). 3 Метод пригоден для определения 10–15 мРНК и оценки их содержания в 5–20 образцах одновременно. 3
• Дифференциальный дисплей (Differential display). 3 Метод не нуждается в знании структуры и служит для сравнения транскриптов. 3