Помимо двойной спирали, существуют и другие формы ДНК, например:

• G-ДНК — четверная спираль с гуаниновыми тетрадами. 1
• H-ДНК — тройная спираль. 1 В ней две цепи соединяются стандартным способом, а третья примыкает к ним сбоку, ложась в большую бороздку между цепями. 1
• G-квадруплексы — спирали из четырёх нитей ДНК или РНК, соединённых одними только гуанинами. 3 Эти образования играют важную роль в регуляции активности генов, в генетической изменчивости и в функционировании теломер. 3
• Крестообразные формы ДНК. 2 Если достаточно длинные вставки палиндромных последовательностей внедрены в плазмидную ДНК, то при определённой плотности сверхспирализации они могут переходить в крестообразную форму. 2
• Z-ДНК — двухцепочечная левозакрученная. 1

Конформация, которую принимает ДНК, зависит от уровня гидратации, последовательности ДНК, количества и направления намотки, химических модификаций оснований, типа и концентрации ионов металлов и присутствия полиаминов в растворе. 5