Несколько эффективных алгоритмов для поиска подпоследовательностей в текстовом файле:

• Алгоритм Ахо-Корастик. 1 Позволяет найти множество подстрок в файле в один проход. 1
• Алгоритм Рабина-Карпа. 1 Позволяет найти вхождение одного шаблона из множества шаблонов в тексте. 1
• Алгоритмы решения задач поиска наибольшей общей подпоследовательности (LCS — longest common subsequence) и выравнивания двух последовательностей (SA — sequence alignment). 2 Они измеряют, насколько текстовые фрагменты похожи глобально друг на друга. 2
• Алгоритм Шинглов. 3 Позволяет предположить, являются ли два объекта частично одинаковыми. 3 Для этого тексты разбивают на подпоследовательности — шинглы, а затем находят контрольные суммы. 3

Выбор конкретного алгоритма зависит от задачи и требований к производительности и точности поиска.