Некоторые альтернативные классификации рыб помимо традиционной:

• Классификация по строению скелета. 4 Различают рыбы с хрящевым скелетом (акулы, скаты), хрящекостным (осетровые) и костным (большинство промысловых рыб). 4
• Классификация по местам обитания. 5 Выделяют экологические группы рыб: пресноводные, проходные, солоноватые и морские. 5
• Классификация, основанная на молекулярно-генетических методах. 1 Она позволяет определить эволюционное родство организмов. 1

Также существует классификация по характеру питания: рыбы могут быть охарактеризованы как хищные, травоядные и питающиеся планктоном. 3