Какие способы существуют для обозначения неочевидных связей в сложноподчиненных предложениях?

Возможно, имелись в виду способы обозначения подчинительной связи в сложноподчинённых предложениях. Некоторые из них:

• Подчинительные союзы. 3 Выполняют роль связующего звена между главным и придаточным предложениями. 3 Союзы выражают определённый вид смысловых отношений (временные, причинные, целевые, условные, уступительные и другие). 3 Примеры: чтобы, пока, будто, как, если, точно, словно, так что, как будто, с тех пор как и другие. 3
• Союзные слова. 3 Выполняют функцию связи и являются членом предложения в придаточной части. 3 К ним относятся относительные местоимения (кто, что, какой, который, каков, чей, сколько) и относительные местоименные наречия (когда, где, куда, зачем, куда, почему, как). 3
• Указательные слова. 1 Часто употребляются в главной части сложноподчинённого предложения и указывают на наличие придаточной части. 1 Примеры: тот, такой, там, туда, оттуда, так, тогда, настолько и другие. 1
• Указательное положение придаточного предложения. 25 Придаточное предложение может располагаться перед главным, в середине главного или после него. 25

Также существует последовательное подчинение, когда одно придаточное зависит от главного, второе — от первого придаточного, третье — от второго и так далее. 2