Существует эволюционное объяснение появления атавизмов и рудиментов. 2 Оно заключается в том, что органы (признаки), ставшие бесполезными для организма, не утрачиваются в одночасье, а могут сохраняться в течение миллионов лет, постепенно редуцируясь и разрушаясь под грузом мутаций. 2

Некоторые теории появления атавизмов:

• Пробуждение генов предков. 3 Атавизмы возникают из-за случайного пробуждения генов предков, долгое время не подававших голоса. 3
• Нарушения в развитии зародыша. 1 Атавистические признаки могут появляться из-за нарушений в развитии зародыша, которые пробуждают давно замолкшие гены. 1

Некоторые теории появления рудиментов:

• Утрата функции. 3 Рудиментарен орган не потому, что нефункционален, но потому, что перестал выполнять функцию, для которой развился в процессе эволюции. 3
• Приобретение новых функций. 2 Рудиментарный орган может приобрести новые функции. 2

Считается, что и атавизмы, и рудименты — результат эволюции. 4