Какие современные подходы используются в молекулярной филогенетике для реконструкции эволюционных связей?

Некоторые современные подходы, которые используются в молекулярной филогенетике для реконструкции эволюционных связей:

• Определение нуклеотидной последовательности отдельных генов или некодирующих участков ДНК и её сравнение у разных организмов. cyberleninka.ru Это позволяет установить конкретные замены нуклеотидов в анализируемом участке ДНК в разных филетических линиях. cyberleninka.ru
• Поиск таксонспецифичных семейств повторяющихся последовательностей или отдельных копий известных повторов, общих для ДНК разных видов. cyberleninka.ru Таким образом выявляют соответствие между эволюцией таксонов и появлением и распространением в геномах отдельных генетических элементов и семейств повторов. cyberleninka.ru
• Сопоставление протяжённых анонимных участков генома с неизвестными функциями и часто неясной локализацией путём сканирования мутаций по всему геному. cyberleninka.ru Для этого используют разные варианты ПЦР, ПДРФ (полиморфизм длины рестрикционных фрагментов), молекулярную ДНК х ДНК-гибридизацию. cyberleninka.ru
• Использование концепции молекулярных часов. cyberleninka.ru web.archive.org Она применяется для оценки времени дивергенции видов и построения филогенетических деревьев. cyberleninka.ru В основу концепции положена модель «нейтральной эволюции», предполагающая стохастическую природу накопления нейтральных мутаций в филетических линиях. web.archive.org
• Применение высокопроизводительного секвенирования. en.wikipedia.org С его помощью получают транскриптома организма, что позволяет делать выводы о филогенетических взаимоотношениях с использованием транскриптомных данных. en.wikipedia.org

Каждый из этих методов имеет свои преимущества и недостатки, и выбор подхода зависит от типа данных и целей исследования. www.progkids.com