Некоторые научные центры, действующие при Кубанском государственном университете (КубГУ):

• Новороссийский учебный и научно-исследовательский морской биологический центр (филиал) КубГУ. 2
• Научно-образовательный центр «Диагностика структуры и свойств наноматериалов». 2
• Научно-образовательный центр «Интеграция». 2
• Научно-образовательный центр «Философские, религиоведческие и социально-исторические исследования». 2
• Научно-исследовательский институт «Мембран». 2
• Научно-образовательная лаборатория «Ионообменные мембраны и процессы». 29

Также в составе КубГУ есть сейсмологическая лаборатория, информационно-аналитический центр, лаборатория робототехники и мехатроники и другие подразделения. 2