Некоторые современные методы систематики растений, которые эффективны для определения их филогенетических связей:

• Сравнительно-морфологический метод. 25 Заключается в сравнительном изучении морфологических особенностей вегетативных и генеративных органов. 2
• Эмбриологический метод. 5 Позволяет устанавливать родственные связи растений на основании изучения развития зародыша, зародышевого мешка, эндосперма. 5
• Палеоботанический метод. 5 Даёт возможность судить о распространении и развитии определённых групп растений, а следовательно, и о их происхождении на основании изучения вымерших растений. 5
• Эколого-географический метод. 5 Позволяет установить определённую связь в формировании растений с условиями существования. 5
• Палинологический метод. 5 Изучает морфологию пыльцы. 5
• Кариологический метод. 24 Основан на изучении числа хромосом и их специфики для каждого вида растений. 2
• Биохимический метод. 24 Основан на том, что близкие виды имеют подобные химические вещества. 2
• Математический метод. 2 Основан на применении математической статистики, компьютерном моделировании. 2