Некоторые современные методы, которые применяются для исследования ДНК древних организмов:

• Лизис и извлечение ДНК. 1 Для этого используются специальные растворы, которые разрушают минеральную часть кости, оставляя только органические молекулы, включая ДНК. 1
• Полимеразная цепная реакция (ПЦР). 12 Метод позволяет размножить маленький фрагмент ДНК до необходимого количества. 1
• Секвенирование нового поколения (NGS). 2 Технология позволяет «прочитать» миллионы коротких фрагментов ДНК одновременно. 1 Это помогает восстановить древние геномы из повреждённых молекул ДНК. 2
• Обработка информации с помощью биоинформатических методов. 1 Компьютерные программы собирают все последовательности ДНК воедино и сравнивают их с известными генетическими базами данных, помогают найти связь между образцом и современными популяциями. 1
• Метагеномный анализ. 5 Подход, при котором выделяют весь генетический материал, содержащийся в образце из окружающей среды. 5 В таком «метагеноме» могут быть фрагменты ДНК тысяч живых существ. 5
• Протеомный анализ. 5 Метод исследования аминокислотного состава протеинов, содержащихся в костях. 5 В останках может совсем не быть ДНК, но сохранится белок коллаген. 5
• Изотопный анализ. 5 Стабильные изотопы, которые попадают в организм с пищей и водой, накапливаются в костях и зубах. 5 Через тысячи и даже миллионы лет, по содержанию тех или иных изотопов в ископаемых останках можно многое узнать о жизни их хозяина. 5