Какие современные методы применяются для секвенирования микробиот?

Некоторые современные методы, которые применяются для секвенирования микробиоты:

• Метагеномное секвенирование 16S рРНК. na-obr.ru dnkom.ru При этом методе секвенируется не весь геном, а лишь те его регионы, по которым можно установить родовую и иногда видовую принадлежность микроорганизмов. na-obr.ru Чаще всего для амплификации выбирают участки гена 16S рибосомальной РНК (16S рРНК). na-obr.ru

• Методы секвенирования нового поколения (next-generation sequencing, NGS). elementy.ru Из концентрата исходной пробы выделяется тотальная ДНК и фрагментируется на относительно короткие участки, нуклеотидные последовательности которых «прочитываются» секвенатором. elementy.ru Затем с помощью вычислительных методов короткие последовательности собираются в контиги — более длинные непрерывно прочитанные участки геномов отдельных организмов, составляющих исходное сообщество. elementy.ru