Некоторые современные методы, которые используются для автоматического выравнивания последовательностей в биологии:
Машинное обучение. www.progkids.com Например, BetaAlign использует глубокое обучение для множественного выравнивания, применяет методы обработки естественного языка. www.progkids.com EdgeAlign применяет глубокое обучение с подкреплением для парного выравнивания ДНК на встраиваемых устройствах. www.progkids.com
Облачные технологии. www.progkids.com Они помогают учёным быстрее обрабатывать большие объёмы данных и точнее выравнивать последовательности. www.progkids.com Например, Geneious Prime запустил Geneious Cloud для управления данными последовательностей. www.progkids.com
Гибридные методы. en.wikipedia.org Ищут наилучшее возможное частичное выравнивание двух последовательностей. en.wikipedia.org Это может быть полезно, когда нисходящая часть одной последовательности перекрывается с восходящей частью другой последовательности. en.wikipedia.org
Точечная матрица сходства. ru.wikipedia.org Способ визуального представления парного выравнивания. ru.wikipedia.org Обычно используется для больших последовательностей, например для геномов бактерий. ru.wikipedia.org
DALI. ru.wikipedia.org Один из популярных методов структурного выравнивания. ru.wikipedia.org Исходные структуры белков разбиваются на гексапептиды, и через оценку паттернов контактов между фрагментами рассчитывается матрица расстояний. ru.wikipedia.org
Примеры полезных ответов Поиска с Алисой на вопросы из разных сфер. Вопросы сгенерированы нейросетью YandexGPT для актуальных тем, которые определяются на базе обобщённых запросов к Поиску с Алисой.