Некоторые риски, связанные с применением инбридинга в собаководстве:

• Инбредная депрессия. 13 Высокая степень гомозиготности у потомства может привести к уменьшению плодовитости, увеличению внутриутробной гибели плодов и числа мёртворождений, снижению выживаемости щенков, увеличению числа аномалий в породе. 1
• Закрепление генетических заболеваний. 2 Необходимо тщательно следить за поведением и здоровьем щенков, удаляя из селекции больных особей. 2
• Отсутствие генетического разнообразия. 24 Постоянное использование инбридинга ведёт к заболеваниям, генетическим отклонениям, хромосомным сбоям, обеднению генофонда. 2
• Проблемы с половой и репродуктивной функцией. 4 Опытные заводчики советуют время от времени вливать в инбредную породу собак, не состоящих в родстве с другими животными. 4

В некоторых случаях инбридинг противопоказан, например если: 2

• Порода молода и её характерные особенности ещё не устоялись. 2 В этом случае высок риск, что щенки будут обладать теми чертами, что присущи другой породе. 2
• Порода отличается небольшим помётом, что, к примеру, относится к декоративным группам. 2
• У предков собак или их родственников были выявлены генетические заболевания и отклонения. 2 Тогда скрещивание особей может привести к закреплению негативных особенностей или даже к вырождению породы. 2

Чтобы избежать негативных последствий, специалисты рекомендуют после ряда близкородственных скрещиваний проводить ауткроссинг, а затем вновь возвращаться к инбридингу. 1