Какие проблемы возникают при систематике бактерий и других микроорганизмов?

Некоторые проблемы, которые возникают при систематике бактерий и других микроорганизмов:

• Отсутствие единых принципов и подходов к объединению или разделению микроорганизмов в различные таксономические единицы. 3 Для них пытаются использовать сходство геномов как общепринятый критерий. 3
• Нечёткое определение понятия «вид» для бактерий. 3 В ряде случаев истинное родство между бактериями может оказаться спорным, поскольку оно лишь отражает общность происхождения от одного далёкого предка. 3
• Неясные родственные связи между микроорганизмами. 3 Многие из них имеют одинаковые морфологические признаки, но различаются по строению геномов. 3
• Кажущаяся простота и элементарность внешней организации бактерий, которая к тому же зависит от среды. 4

Для систематики микроорганизмов используются разные подходы, например:

• Нумерическая таксономия. 2 Признаёт равноценность всех признаков, видовая принадлежность устанавливается по числу совпадающих признаков. 2
• Серотаксономия. 2 Изучает антигены бактерий с помощью реакций с иммунными сыворотками. 2
• Хемотакcономия. 2 Применяются физико-химические методы, с помощью которых исследуется липидный, аминокислотный состав микробной клетки и определённых её компонентов. 2
• Генная систематика. 2 Основана на способности бактерий с гомологичными ДНК к трансформации, трансдукции и конъюгации, на анализе внехромосомных факторов наследственности — плазмид, транспозонов, фагов. 2