Некоторые проблемы, которые возникают при использовании информационных технологий в финансово-экономическом анализе:

• Неструктурированность данных. 2 На большинстве российских предприятий информация хранится в различных подразделениях и представлена в электронных таблицах, небольших базах данных и бумажных архивах. 2 Её сложно анализировать для получения достоверных выводов о реальном финансовом состоянии предприятия. 3
• Сложности на начальных этапах. 4 Нечёткость и неполнота системных требований, нерешённые вопросы и ошибки, допущенные на этапах анализа и проектирования, порождают на последующих этапах трудные и неразрешимые проблемы. 4
• Трудоёмкость и сложность внедрения программ. 4 Затраты на качественный запуск программы, как правило, значительно превышают затраты на приобретение программы и компьютеров. 4
• Ограничения детализации плана счетов. 4 Вынесение на план счетов слишком большого количества внутренней информации может существенно затруднить работу бухгалтерии и вызвать неоправданное усложнение плана счетов. 4
• Проблемы с безопасностью данных. 15 Необходимо принимать меры для защиты данных от утечек и киберугроз. 15