Некоторые проблемы, которые возникают при интеграции электронных дневников в систему образования:

• Трудоёмкость технического внедрения. 1 Для работы с системой необходимы свободный доступ учителя к компьютеру, сервер, системный администратор. 1
• Отсутствие доступа к интернету у некоторых участников образовательного процесса. 1 Например, в сельских школах не во всех сёлах есть интернет, поэтому родители не могут посмотреть электронный дневник своего ребёнка. 1
• Риск порчи информации. 3 Электронный дневник реализован на основе интернет-сайта и веб-технологий, существует вероятность взлома. 3
• Нежелание сотрудников переходить на новую технологию. 3 Некоторые из них не имеют навыков работы с компьютером и не хотят осваивать новую технологию. 3
• Утрата воспитательной функции дневника. 2 Дистанционная форма дневника лишает ребёнка инструмента самоорганизации и снимает с него ответственность за организацию учебного процесса. 2