Некоторые природные красители, которые используются в современной гистологии:

• Гематоксилин. 15 Получают из кампешевого дерева, произрастающего в Центральной Америке. 1 Гематоксилин окрашивает ядра в сине-фиолетовый цвет. 5
• Кармин. 5 Окрашивает ядра в светло-красный цвет. 5
• Сафранин. 5 Даёт тёмно-красную окраску. 5
• Тионин. 5 Синий краситель. 5
• Эозин. 5 Окрашивает цитоплазму в розовый цвет. 5
• Ауранция. 5 Окрашивает в жёлто-сероватый цвет. 5
• Пикриновая кислота. 5 Окрашивает в жёлтый цвет. 5
• Фуксин. 5 Окрашивает в кирпичный цвет. 5
• Индигокармин. 5 Окрашивает в синий цвет. 5
• Оранж. 5 Окрашивает в оранжевый цвет. 5

Также для окрашивания определённых включений в клетке используют, например, судан III (окрашивает липиды в оранжевый цвет), судан чёрный (липиды выделяются чёрным цветом), муцикармин (окрашивает слизь в буро-фиолетовый цвет), тионин (окрашивает слизь в голубой цвет) и другие. 5