Несколько причин, которые могут вызвать ошибку «Could not open JPA EntityManager for transaction» в Spring Boot с MySQL:

• Неправильные настройки подключения к базе данных. 1 Стоит проверить, что все пункты инструкции по установке выполнены верно, а также убедиться в корректности настроек MySQL. 1
• Проблемы с часовым поясом. 2 Например, в одном из случаев ошибка возникла из-за разницы в часовых поясах. 2
• Длительный простой сервера. 4 После длительного простоя без доступа к базе данных может возникать ошибка. 4
• Некорректная конфигурация пула подключений. 3 Например, если процесс может выполняться в течение нескольких минут, когда сервис начинает работать, он может занять одно свободное подключение к базе данных из пула подключений. 3

Для точной диагностики и устранения причины ошибки рекомендуется обратиться к специалисту.