Преимущества выращивания чистых культур микроорганизмов по сравнению со смешанными культурами:

• Возможность изучать физиологические и биохимические особенности микроорганизмов. 4 Для этого используются чистые культуры, включающие представителей одного вида. 4
• Возможность готовить диагностические, лечебные и профилактические препараты. 3 Чистые культуры микроорганизмов также служат основой промышленного получения многих антибиотиков, витаминов, вакцин, ферментов, органических кислот и других соединений. 4
• Получение одинаковых колоний. 15 Из чистой культуры обычно вырастают одинаковые колонии, и при микроскопировании выявляются схожие клетки, в частности по морфологии и результатам окраски. 15

Смешанные культуры, в свою очередь, применяются, например, для очистки бытовых и промышленных сточных вод, борьбы с загрязнениями почвы и воды нефтью, для бактериального выщелачивания металлов. 4