Некоторые преимущества метода рекомбинантных плазмид в сравнении с другими методами биотехнологии:

• Лёгкость проведения манипуляций с последовательностью. 3 Размер плазмид, используемых в генетической инженерии, делает их удобными для выделения, очистки и модификации полинуклеотидной цепи. 3
• Автономная репликация. 3 Плазмиды способны к автономной репликации, поэтому можно с лёгкостью получить необходимое количество копий плазмидной ДНК, используя недорогие среды и быстро делящиеся клетки. 3
• Стабильность. 3 Плазмиды стабильны в течение длительного времени в виде очищенной молекулы ДНК или внутри трансформированных бактериальных клеток, хранящихся при низкой температуре в виде глицериновых стоков. 3
• Возможность использования в различных организмах и исследованиях. 3 С применением плазмид можно проводить экспрессию гена не только в бактериальных клетках, но и в клетках эукариот, включая клетки растений и млекопитающих. 3
• Придание бактериям новых свойств. 4 Плазмиды придают бактериям, например, устойчивость к антибиотикам, и позволяют вести селекцию бактерий, в которых содержится та или иная плазмида. 4